La deuxième région concernée par les qualifications fut la zone Afrique en mars 2005 avec six équipes dispatchées entre la Poule du nord et celle du sud. Les deux mieux placées se retrouvraient pour savoir qui poursuivrait en Round 1B.
Le Sénégal gagna son ticket pour la Poule Nord après ses victoires sur le Nigéria 46-6 et le Cameroun 6-0, le plus petit score obtenu sur les 191 matches de qualification en vue de cette Coupe du Monde de Rugby.
Le Sénégal a ensuite été rejoint par la Zambie en match de barrage, vainqueur sur le Botswana grâce à la différence de points. Le Sénégal se remit d’un 14-13 à la mi-temps pour remporter le match aller 22-14 grâce au demi d’ouverture Steeve Sargos, inscrivant à lui seul 17 points. Une semaine plus tard à Lusaka, un carton plein de Sargos ramenait une fois encore le Sénégal d’une probable défaite pour finir le match 13-6.
Dans le même temps, le Round 1B voyait s’affronter le Zimbabwe, la Côte d’Ivoire, le Kenya, Madagascar et l’Ouganda dans deux Poules bien distinctes dont les vainqueurs étaient qualifiés pour la phase suivante et les vice-champions jouaient leur place au repêchage.
Le Zimbabwe et la Côte d’Ivoire, qui se qualifièrent respectivement pour la Coupe du Monde de Rugby en 1991 et 1995, marquèrent un arrêt à la performance du Sénégal avant de se retrouver à Abidjan pour déterminer qui se retrouverait en tête de la Poule A. Une victoire 33-3 des locaux poussa le Zimbabwe en match de barrage face à l’Ouganda, la tête du groupe échouant au Kenya, après avoir battu l’Ouganda 8-5 et concédé un match nul 24-24 contre Madagascar à Nairobi.
Les deux équipes remportèrent leur match aller mais, après sa victoire 36-31, l’Ouganda se hissa en Round 2 où se trouvaient la Tunisie, le Maroc et la Namibie, portant ainsi le nombre de pays à se qualifier pour la zone Afrique à 14.
La Namibie démarra en trombe la Poule A avec une incontestable victoire 82-12 sur le Kenya à Windhoek. Une lourde leçon reprise à temps pour accueillir la Tunisie et arriver à la battre 25-21. Malgré tout, ce fut la Namibie qui se qualifia finalement pour jouer la finale des play-offs, dernière étape pour tenter de représenter la zone Afrique lors de la prochaine Coupe du Monde de Rugby.
Face à la Namibie, le Maroc réussit également à se qualifier en battant à l’aller et au retour l’Ouganda, puis la Côte d’Ivoire. L’Ouganda ne s’en sorti pas trop mal grâce notamment à l’arrivée de l’ancien ailier Springbok Chester Williams en tant que directeur technique. En juillet 2007, ses joueurs purent ainsi battre la Côte d’Ivoire 32-7 à Kampala. Autre avantage qui leur permit de parvenir à un stade jamais atteint auparavant dans des phases qualificatives, l’arrivée de l’ancien boxer Robert Seguya en position de demi de mêlée.
Restait donc à savoir qui de la Namibie et du Maroc pourrait se glisser dans la Poule D aux côtés de la France, l’Argentine, l’Irlande et la Géorgie. Même le perdant pouvait prétendre à espérer une place en Coupe du Monde grâce aux repêchages. Mais c’est finalement la Namibie qui y parvint, remportant le match aller 25-7 puis triomphant à Casablanca 27-8 avec le centre Melrick Africa leur meilleur marqueur d’essais. Ne restait plus qu’au Maroc une ultime chance : celle de s’imposer face au Portugal dans les repêchages. On connait la suite.
